Paquet : i2masschroq (0.4.54-1) [debports]

[ Paquet source :  ]

Successor of X!TandemPipeline

The program allows one to perform the following tasks:

 -Reads X!Tandem xml results files
 -Reads MASCOT dat results files
 -Reads TPP pepXML results files
 -Reads PSI mzIdentML results files
 -Run X!Tandem analyzes through a graphical user interface
 -Implements various filters based on statistical values
 -Powerful original grouping algorithm to filter redundancy
 -Phosphopeptide mode to handle phosphoproteomics datasets
 -Edit, search and sort the data graphically
 -XIC chromatogram browser (eXtracted Ion Current)
 -Comparisons of theoretical isotope patterns to measured MS1 XIC areas
 -Export data directly to Microsoft Office 2010 and LibreOffice (ods export)
 -Handle huge datasets very quickly
 -Perform peptide quantification through MassChroQml export

Autres paquets associés à i2masschroq

• dep: libc6 (>= 2.32)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgrantlee-templates5 (>= 5.0.0)

  Grantlee templating library for Qt - Templates

• dep: libodsstream0

  C++ library to read or write ODS files

• dep: libpappsomspp-widget0

  C++ library to handle mass spectrometry data (GUI runtime)

• dep: libpappsomspp0

  C++ library to handle mass spectrometry data (non-GUI runtime)

• dep: libqcustomplot2.0 (>= 2.0.1+dfsg1)

  Paquet indisponible

• dep: libqt5core5a (>= 5.15.1)

  module principal de QT⋅5

• dep: libqt5gui5 (>= 5.8.0)

  module Qt⋅5 d'interface graphique

  ou libqt5gui5-gles (>= 5.8.0)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5network5 (>= 5.14.1)

  module réseau de Qt⋅5

• dep: libqt5printsupport5 (>= 5.0.2)

  Qt 5 print support module

• dep: libqt5widgets5 (>= 5.15.1)

  module de widgets de Qt⋅5

• dep: libqt5xml5 (>= 5.1.0)

  Qt 5 XML module

• dep: librdata0

  Read and write R data frames from C (runtime files)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: tandem-mass

  logiciel de spectrométrie de masse pour l’identification de protéines

• rec: i2masschroq-tools

  X!Tandem-related utilities for timsTOF pro and modern mzML data

Télécharger i2masschroq

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64 (portage non officiel)	1 102,0 ko	3 785,0 ko	[liste des fichiers]