Paquet : tombo (1.5.1-7) [debports]

[ Paquet source :  ]

identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data

Tombo is a suite of tools primarily for the identification of modified nucleotides from nanopore sequencing data. Tombo also provides tools for the analysis and visualization of raw nanopore signal.

Autres paquets associés à tombo

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-h5py

  interface généraliste de Python pour hdf5

• dep: python3-mappy

  Python3 interface minimap2

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3

• dep: python3-numpy-abi9

  paquet virtuel fourni par python3-numpy

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• dep: python3-tqdm

  fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool

• rec: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• rec: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

Télécharger tombo

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
hppa (portage non officiel)	496,0 ko	1 812,0 ko	[liste des fichiers]