Paquet : snpomatic (1.0-7) [debports]

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logiciel de mappage strict et rapide de « lectures courtes »

Les technologies de séquençage à haut débit génèrent de grandes quantités de courtes lectures. Leur mappage vers une séquence de référence consomme de grandes quantités de temps de processeur et de mémoire et les erreurs de mappage de lectures peuvent conduire à des alignements bruités ou incorrects.

SNP-o-matic est un logiciel de mappage strict de « lectures courtes ». Il gère un grand nombre de types et de formats de sortie pour des utilisations dans le filtrage de lectures, les alignements, les appels de création de génotypes basés sur les séquences, le réassemblage assisté de contigs, etc.

Autres paquets associés à snpomatic

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger snpomatic

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
hppa (portage non officiel)	76,0 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]