Paquet : r-bioc-shortread (1.60.0-2) [debports]
Liens pour r-bioc-shortread
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [bioconductor.org]
Paquets similaires :
GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data
This BioConductor module is a package for input, quality assessment, manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access to additional facilities for advanced statistical analysis, data transformation, visualization and integration with diverse genomic resources.
Autres paquets associés à r-bioc-shortread
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.7)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: r-api-4.0
- paquet virtuel fourni par r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.18
- Paquet indisponible
-
- dep: r-bioc-biobase
- fonctions de base pour Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocparallel
- BioConductor facilities for parallel evaluation
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6)
- BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)
- conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
-
- dep: r-bioc-rhtslib
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2)
- importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-xvector
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
-
- dep: r-cran-hwriter
- éditeur HTML – production d’objets de R au format HTML
-
- dep: r-cran-lattice
- paquet GNU R pour les graphes « Trellis »
-
- dep: r-cran-latticeextra
- paquet de GNU R d’affichages graphiques supplémentaires basés sur les treillis
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-biomart
- interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)
-
- sug: r-bioc-genomicfeatures
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
-
- sug: r-cran-runit
- paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires
Télécharger r-bioc-shortread
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|
hppa (portage non officiel) | 5 064,8 ko | 7 527,0 ko | [liste des fichiers] |