Paquet : ont-fast5-api (4.0.2+dfsg-1 et autres) [debports]

[ Paquet source :  ]

simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format

Ont_fast5_api is a simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format.

It provides:

 * Concrete implementation of the fast5 file schema using the generic h5py
   library
 * Plain-english-named methods to interact with and reflect the fast5 file
   schema
 * Tools to convert between multi_read and single_read formats
 * Tools to compress/decompress raw data in files

Autres paquets associés à ont-fast5-api

• dep: libc6 (>= 2.2)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 4.4)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libvbz-hdf-plugin-dev

  VBZ compression plugin for nanopore signal data (devel)

• dep: libzstd1 (>= 1.5.2)

  algorithme de compression rapide sans perte

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.11)

  dep: python3 (>= 3.10~)

• dep: python3-h5py-serial

  general-purpose Python interface to hdf5 (Python 3 serial)

• dep: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• dep: python3-packaging

  core utilities for python3 packages

• dep: python3-progressbar

  text progress bar library for Python (Python 3)

Télécharger ont-fast5-api

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
hppa (portage non officiel)	4.0.2+dfsg-1+b1	48,4 ko	240,0 ko	[liste des fichiers]