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Paquet : hmmer-examples (3.4+dfsg-2 et autres)

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profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences – exemples

HMMER est une implémentation des profils de modèles de Markov cachés pour rechercher des séquences biologiques dans des banques de données en les interrogeant avec des alignements multiples de séquences.

À partir d'un alignement multiple de séquences, HMMER construit un modèle statistique appelé « modèle de Markov caché », qui peut ensuite être utilisé pour interroger une banque de séquences afin de trouver plus d'homologues à la famille de séquences et, éventuellement, de les aligner.

Ce paquet fournit des exemples de fichier pour tester le paquet hmmer.

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Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 3.4+dfsg-2 31 707,8 ko33 404,0 ko [liste des fichiers]
arm64 3.4+dfsg-2+b1 30 106,7 ko31 864,0 ko [liste des fichiers]
armhf 3.4+dfsg-2+b1 30 485,5 ko32 178,0 ko [liste des fichiers]
i386 3.4+dfsg-2 30 535,4 ko32 222,0 ko [liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel) 3.4+dfsg-2 29 787,8 ko31 488,0 ko [liste des fichiers]
x32 (portage non officiel) 3.4+dfsg-2 31 482,7 ko33 175,0 ko [liste des fichiers]