Paquet : emboss (6.6.0+dfsg-15 et autres)

[ Paquet source : emboss  ]

ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

EMBOSS (« European Molecular Biology Open Software Suite ») est un paquet de logiciels d'analyse libre et gratuit, spécialement développé pour les besoins de la communauté d'utilisateurs de la biologie moléculaire (par exemple EMBnet – « European Molecular Biology network »). Le logiciel prend automatiquement en charge les données dans divers formats et permet même une recherche transparente des données de séquences à partir du web. De plus, comme des bibliothèques importantes sont fournies avec le paquet, il s'agit d'une plate-forme permettant aux autres scientifiques de développer et publier des logiciels dans l'esprit du libre. EMBOSS intègre également un ensemble de paquets actuellement disponibles et des outils pour l'analyse de séquences dans un tout cohérent. EMBOSS casse la tendance historique vers des logiciels commerciaux.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, field::biology:molecular, implemented-in::c, Interface utilisateur: Ligne de commande, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::suite, scope::utility, But: Analyse, Comparaison, use::converting, use::editing, Gestion de données, Recherche, use::text-formatting, use::typesetting, Visualisation de données, Format pris en charge: works-with-format::TODO, works-with-format::plaintext, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire, works-with::db, works-with::text

Autres paquets associés à emboss

• dep: emboss-data (= 6.6.0+dfsg-12) [hppa, m68k, sh4]

  fichiers de données pour le paquet EMBOSS

  dep: emboss-data (= 6.6.0+dfsg-13) [x32]

  dep: emboss-data (= 6.6.0+dfsg-15) [non hppa, m68k, sh4, x32]

• dep: emboss-lib (= 6.6.0+dfsg-12) [hppa, m68k, sh4]

  EMBOSS Libraries

  dep: emboss-lib (= 6.6.0+dfsg-13) [x32]

  dep: emboss-lib (= 6.6.0+dfsg-15) [non hppa, m68k, sh4, x32]

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

  bibliothèque C d'analyse syntaxique XML - bibliothèque d'exécution

• dep: libgd3 (>= 2.1.0~alpha~) [sparc64]

  bibliothèque graphique GD

• dep: libhpdf-2.3.0 (>= 2.3.0) [sparc64]

  C library for generating pdf files

• dep: libmariadb3 (>= 3.0.0) [sparc64]

  bibliothèque du client de base de données MariaDB

• dep: libpng16-16t64 (>= 1.6.2) [sparc64]

  bibliothèque PNG –⋅exécutable (version⋅1.6)

• dep: libpq5 [sparc64]

  bibliothèque C cliente pour PostgreSQL

• dep: libx11-6

  bibliothèque X11 partie client

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: dialign

  alignement de plusieurs séquences par segments

• rec: primer3

  outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN

• sug: clustalw

  alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

• sug: embassy

  Paquet indisponible

• sug: emboss-doc

  documentation pour EMBOSS

• sug: emboss-test

  fichiers de test pour le paquet EMBOSS

Télécharger emboss

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-15	1 045,2 ko	18 641,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	6.6.0+dfsg-15	1 047,0 ko	6 088,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	6.6.0+dfsg-15	997,9 ko	18 640,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-12	1 008,9 ko	4 306,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-15	1 180,3 ko	5 956,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-12	1 046,1 ko	4 922,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	6.6.0+dfsg-15	1 039,4 ko	18 707,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-15	1 076,8 ko	18 640,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	6.6.0+dfsg-15	1 075,4 ko	18 640,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	6.6.0+dfsg-15	1 004,6 ko	4 580,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-12	1 133,3 ko	18 378,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-15	1 135,7 ko	269 374,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	6.6.0+dfsg-13	1 034,9 ko	5 456,0 ko	[liste des fichiers]