Paquet : bioawk (1.0-5 et autres)

[ Paquet source : bioawk  ]

extension d’awk pour l’analyse de séquences biologiques

Bioawk est une extension du awk de Brian Kernighan, ajoutant la prise en charge de plusieurs formats communs de données de biologie, incluant les formats facultativement compressés par gzip, BED, GFF, SAM, VCF, FASTA/Q et délimités par des tabulations avec des noms de colonne. Il ajoute des fonctions internes et une option en ligne de commande pour utiliser les tabulations comme délimiteurs d’entrée/sortie. Quand cette nouvelle fonctionnalité n’est pas utilisée, bioawk est prévu pour se comporter comme l’awk originel de Brian Wilson Kernighan.

Autres paquets associés à bioawk

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [non armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

  Bibliothèque de compression - binaires

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

Télécharger bioawk

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.0-5	53,6 ko	212,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.0-5	55,7 ko	163,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0-5+b1	52,1 ko	212,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0-5	50,7 ko	150,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0-5	49,7 ko	118,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.0-5	50,3 ko	147,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0-5	59,2 ko	174,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.0-5	70,5 ko	282,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.0-5	50,4 ko	153,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0-5	55,0 ko	220,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.0-5	59,4 ko	211,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0-5	60,9 ko	211,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.0-5	57,9 ko	147,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0-5	55,6 ko	171,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.0-5	60,9 ko	146,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.0-5	48,0 ko	1 045,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.0-5	56,1 ko	150,0 ko	[liste des fichiers]