Paquet : meryl (0~20150903+r2013-9)

[ Paquet source : kmer  ]

in- and out-of-core kmer counting and utilities

meryl computes the kmer content of genomic sequences. Kmer content is represented as a list of kmers and the number of times each occurs in the input sequences. The kmer can be restricted to only the forward kmer, only the reverse kmer, or the canonical kmer (lexicographically smaller of the forward and reverse kmer at each location). Meryl can report the histogram of counts, the list of kmers and their counts, or can perform mathematical and set operations on the processed data files.

This package is part of the Kmer suite.

Autres paquets associés à meryl

• dep: libc6 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• sug: gridengine-client

  utilitaires pour la gestion de file d’attente de Grid Engine

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armhf	200,5 ko	1 250,0 ko	[liste des fichiers]