Paquet : vt (0.57721+ds-3 et autres)

[ Paquet source : vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Autres paquets associés à vt

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nouvelle bibliothèque d'expressions rationnelles compatibles Perl –⋅fichiers d'exécution⋅8⋅bits

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 ko	2 361,0 ko	[liste des fichiers]