Paquet : uncalled (2.3+ds-3 et autres) [debports]

[ Paquet source :  ]

Utility for Nanopore Current Alignment to Large Expanses of DNA

Streaming algorithm for mapping raw nanopore signal to DNA references

Enables real-time enrichment or depletion on Oxford Nanopore Technologies (ONT) MinION runs via ReadUntil.

Also supports standalone signal mapping of fast5 reads

Autres paquets associés à uncalled

• dep: libc6.1 (>= 2.38)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhdf5-310 (>= 1.14.3)

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.12~)

• dep: python3-numpy

  bibliothèque de Python pour des calculs numériques – Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger uncalled

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	2.3+ds-3+b1	727,8 ko	4 183,0 ko	[liste des fichiers]