Paquet : r-bioc-metagenomeseq (1.46.0-1)

[ Paquet source : r-bioc-metagenomeseq  ]

GNU R statistical analysis for sparse high-throughput sequencing

MetagenomeSeq is designed to determine features (be it Operational Taxanomic Unit (OTU), species, etc.) that are differentially abundant between two or more groups of multiple samples. metagenomeSeq is designed to address the effects of both normalization and under-sampling of microbial communities on disease association detection and the testing of feature correlations.

Autres paquets associés à r-bioc-metagenomeseq

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.64.0)

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-limma (>= 3.60.4)

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• dep: r-bioc-wrench (>= 1.22.0)

  normalisation wrench de GNU R pour des données éparses de comptage

• dep: r-cran-foreach

  GNU R foreach looping support

• dep: r-cran-glmnet

  Lasso and Elastic-Net Regularized Generalized Linear Models

• dep: r-cran-gplots

  paquet de GNU R d’outils de tracé de données de Greg Warnes et autres

• dep: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-bioc-annotate (>= 1.82.0)

  annotations de BioConductor pour les puces à ADN

• sug: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• sug: r-bioc-biomformat (>= 1.32.0)

  GNU R interface package for the BIOM file format

• sug: r-bioc-ihw (>= 1.32.0)

  GNU R independent hypothesis weighting

• sug: r-cran-gss

  GNU R package for multivariate estimation using smoothing splines

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-testthat (>= 0.8)

  GNU R testsuite

• sug: r-cran-vegan

  Community Ecology Package for R

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