Paquet : lagan (2.0-10) [debports]

[ Paquet source :  ]

alignement global de séquences génomiques par paire, hautement paramétrable

Lagan prend des alignements locaux générés par CHAOS comme ancres et limite la zone de recherche de l’algorithme de Needleman-Wunsch aux alentours de ces ancres.

Multi-LAGAN est une généralisation de l’algorithme d’alignement multiple par paire de séquences. M-LAGAN réalise des alignements progressifs par paire contrôlés par un arbre phylogénétique spécifié par l’utilisateur. Les alignements sont alignés avec d’autres alignements en utilisant une métrique de somme des paires.

Autres paquets associés à lagan

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	178,8 ko	1 898,0 ko	[liste des fichiers]