Paquet : dascrubber (1.1-4) [debports]

[ Paquet source :  ]

alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads

The Dazzler Scrubbing Suite produces a set of edited reads that are guaranteed to

 * be continuous stretches of the underlying genome (i.e. no unremoved
   adapters and not chimers)
 * have no very low quality stretches (i.e. the error rate never exceeds some
   reasonable maximum, 20% or so in the case of Pacbio data).

Its secondary goal is to do so with the minimum removal of data and splitting of reads.

Autres paquets associés à dascrubber

• dep: libc6.1 (>= 2.7)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

• sug: daligner

  alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide

• sug: dazzdb

  manage nucleotide sequencing read data

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	159,8 ko	1 381,0 ko	[liste des fichiers]