Paquet : r-bioc-genomeinfodb (1.42.1+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-genomeinfodb  ]

Paquet « expérimental »

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BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

This package contains BioConductor utilities for manipulating chromosome and other 'seqname' identifiers.

The Seqnames package contains data and functions that define and allow translation between different chromosome sequence naming conventions (e.g., "chr1" versus "1"), including a function that attempts to place sequence names in their natural, rather than lexicographic, order.

Autres paquets associés à r-bioc-genomeinfodb

• dep: r-api-4.0

  Paquet indisponible

• dep: r-api-bioc-3.20

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodbdata

  BioConductor species and taxonomy ID look up tables

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.25.12)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-ucsc.utils

  Low-level utilities to retrieve data from the UCSC Genome Browser

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-bsgenome

  infrastructure de BioConductor pour les paquets de données de génome basés sur Biostrings

• sug: r-bioc-genomicalignments

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• sug: r-bioc-rsamtools

  importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R

• sug: r-cran-data.table

  GNU R extension of Data.frame

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-r.utils

  GNU R various programming utilities

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	3 753,8 ko	5 034,0 ko	[liste des fichiers]