Paquet : python3-mappy (2.24+dfsg-4~0exp et autres) [debports]

[ Paquet source :  ]

Paquet « expérimental »

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Python3 interface minimap2

Minimap2 is a versatile sequence alignment program that aligns DNA or mRNA sequences against a large reference database. Typical use cases include: (1) mapping PacBio or Oxford Nanopore genomic reads to the human genome; (2) finding overlaps between long reads with error rate up to ~15%; (3) splice-aware alignment of PacBio Iso-Seq or Nanopore cDNA or Direct RNA reads against a reference genome; (4) aligning Illumina single- or paired-end reads; (5) assembly-to-assembly alignment; (6) full- genome alignment between two closely related species with divergence below ~15%.

This package contains the Python3 interface for using minimap2.

Autres paquets associés à python3-mappy

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

  dep: python3 (<< 3.12)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger python3-mappy

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
riscv64 (portage non officiel)	2.24+dfsg-4~0exp+b1	160,3 ko	320,0 ko	[liste des fichiers]