Paquet : trinityrnaseq-examples (2.6.6+dfsg-6)

[ Paquet source : trinityrnaseq  ]

assemblage de novo de séquences d’Arn – fichiers de test et d’exemple

Trinity représente une méthode originale pour une reconstruction efficace et robuste de transcriptomes à partir de données de séquences d’ARN. Trinity combine trois modules logiciels indépendants : Inchworm, Chrysalis et Butterfly, appliqués séquentiellement à de grandes quantités de lectures de séquences d’ARN. Trinity sépare les données de séquence en plusieurs graphes de De Bruijn individualisés, chacun représentant la complexité transcriptionnelle pour un gène ou un locus donné, et puis traite chaque graphe séparément pour extraire les isoformes d’épissage en totalité et pour séparer les transcriptions obtenues de gènes paralogues.

Ce paquet fournit les fichiers de test et d’exemple.

Autres paquets associés à trinityrnaseq-examples

• dep: coreutils

  utilitaires GNU principaux

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• rec: trinityrnaseq

  assemblage de novo de séquences d’Arn

Télécharger trinityrnaseq-examples

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	223 118,8 ko	333 194,0 ko	[liste des fichiers]