Paquet : stacks-web (2.2+dfsg-1)

[ Paquet source : stacks  ]

web interface for displaying loci from short-read sequences

Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.

This package provides the web-based viewer which you can use to examine Stacks output that has been loaded into a MySQL database.

Autres paquets associés à stacks-web

• dep: apache2

  Serveur HTTP Apache

  ou httpd

  paquet virtuel fourni par apache2, ebhttpd, lighttpd, micro-httpd, mini-httpd, nginx-extras, nginx-full, nginx-light, tntnet, webfs, yaws

• dep: default-mysql-server

  MySQL database server binaries and system database setup (metapackage)

  ou virtual-mysql-server

  paquet virtuel fourni par mariadb-server-10.3

• dep: libapache2-mod-php

  langage de script inclus dans du HTML et exécuté côté serveur (module Apache 2 — version par défaut)
  un paquet virtuel est également fourni par libapache2-mod-php7.3

  ou php-cgi

  server-side, HTML-embedded scripting language (CGI binary) (default)
  un paquet virtuel est également fourni par php7.3-cgi

• dep: libdbd-mysql-perl

  interface Perl5 pour les bases de données MariaDB ou MySQL

• dep: php-mdb2-driver-mysql

  mysql MDB2 driver

• rec: stacks

  pipeline for building loci from short-read DNA sequences

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	87,0 ko	381,0 ko	[liste des fichiers]