Paquet : beagle (5.0-180928+dfsg-1+deb10u1)

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Paquets similaires :

appel de génotype, phasage de génotype et attribution de marqueurs non génotypés

Beagle réalise l'appel de génotype, le phasage de génotype, l'attribution de marqueurs non génotypés et la détection de segments identiques par descente. L'attribution génotypique fonctionne sur des haplotypes phasés grâce à un modèle de fréquence d'haplotype de Li et Stephens. Beagle implémente aussi l'algorithme IBD raffiné pour détecter les segments homozygotes par descente (HBD) et identiques par descente (IBD).

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::java, interface::commandline, Rôle: Programme, But: Analyse

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dep: libhtsjdk-java

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