Paquet : beagle (5.0-180928+dfsg-1+deb10u1)
Liens pour beagle
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source beagle :
- [beagle_5.0-180928+dfsg-1+deb10u1.dsc]
- [beagle_5.0-180928+dfsg.orig.tar.xz]
- [beagle_5.0-180928+dfsg-1+deb10u1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [faculty.washington.edu]
Paquets similaires :
appel de génotype, phasage de génotype et attribution de marqueurs non génotypés
Beagle réalise l'appel de génotype, le phasage de génotype, l'attribution de marqueurs non génotypés et la détection de segments identiques par descente. L'attribution génotypique fonctionne sur des haplotypes phasés grâce à un modèle de fréquence d'haplotype de Li et Stephens. Beagle implémente aussi l'algorithme IBD raffiné pour détecter les segments homozygotes par descente (HBD) et identiques par descente (IBD).
Autres paquets associés à beagle
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- dep: default-jre
- environnement d'exécution Java standard ou compatible
- ou java11-runtime
- paquet virtuel fourni par default-jre, openjdk-11-jre
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- dep: libhtsjdk-java
- Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats
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- sug: beagle-doc
- documentation pour Beagle
Télécharger beagle
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 273,8 ko | 573,0 ko | [liste des fichiers] |