Paquet : libbio-asn1-entrezgene-perl (1.720-2)

[ Paquet source : libbio-asn1-entrezgene-perl  ]

analyseur d'enregistrements Entrez Gene et Sequence du NCBI.

Bio::ASN1::EntrezGene et Bio::ASN1::Sequence sont des analyseurs basés sur les expressions rationnelles pour les bases de données de génome Entrez Gene du NCBI (National Center for Biotechnology Information –⋅<http://www.ncbi.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=gene>).

Ils analysent les enregistrements Entrez Gene au format ASN.1 et les séquences du NCBI, et renvoient les structures de données qui contiennent tous les éléments de donnée des enregistrements de gènes ou de séquences.

L'analyseur rendra compte des erreurs et de leur numéro de ligne si les données entrées ne sont pas conformes au format de fichier de génome Entrez Gene du NCBI ou d'annotation de Sequence du NCBI.

Bio::ASN1::Sequence est pour l'essentiel une version modifiée de l'analyseur à haute performance Bio::ASN1::EntrezGene. Néanmoins, ce module autonome existe dans la mesure où il est plus efficace pour extraire le code spécifique à Sequence d'EntrezGene.pm.

Étiquettes: Développement de logiciel: Programmation Perl, Bibliothèques, Domaine: field::biology, field::biology:bioinformatics, Mis en œuvre en: implemented-in::perl, interface::commandline, Rôle: Programme, Format pris en charge: Texte simple

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