Paquet : snakemake (5.4.0-1)

[ Paquet source : snakemake  ]

pythonic workflow management system

Build systems like GNU Make are frequently used to create complicated workflows, e.g. in bioinformatics. This project aims to reduce the complexity of creating workflows by providing a clean and modern domain specific language (DSL) in Python style, together with a fast and comfortable execution environment.

Autres paquets associés à snakemake

• dep: ca-certificates

  certificats CA courants

• dep: libjs-d3

  JavaScript visualization library for HTML and SVG

• dep: libjs-mathjax

  JavaScript display engine for LaTeX and MathML

• dep: libjs-sphinxdoc (>= 1.0)

  prise en charge de JavaScript pour la documentation de Sphinx

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-appdirs

  détermination des répertoires adéquats selon la plateforme – Python 3

• dep: python3-configargparse

  replacement for argparse with config files and environment variables (Python 3)

• dep: python3-datrie

  Super-fast, efficiently stored Trie for Python 3

• dep: python3-docutils

  système de traitement de texte pour reStructuredText – implémentation en Python 3

• dep: python3-git

  Python library to interact with Git repositories - Python 3.x

• dep: python3-jsonschema

  une (autre) implémentation de JSON Schema (Draft 3 et 4) – Python 3.x

• dep: python3-networkx

  tool to create, manipulate and study complex networks (Python3)

• dep: python3-psutil

  module fournissant des fonctions pratiques pour la gestion de processus –⋅Python3

• dep: python3-pygraphviz

  interface Python pour le paquet de composition de graphes et de visualisation, Graphviz –⋅Python⋅3

• dep: python3-pytools

  big bag of things supplementing Python 3 standard library

• dep: python3-ratelimiter

  simple Python library for limiting the rate of operations

• dep: python3-recommonmark

  CommonMark utility for Docutils and Sphinx projects -- Python 3

• dep: python3-requests

  bibliothèque HTTP simple et élégante pour Python3, construite pour les êtres humains

• dep: python3-rpy2

  Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)

• dep: python3-setuptools

  Améliorations de Python3 Distutils

• dep: python3-wrapt

  décorateurs, enveloppes et extensions – Python 3.x

• dep: python3-yaml

  analyseur et générateur de code YAML pour Python3

• dep: sphinx-rtd-theme-common (>= 0.4.2+dfsg)

  sphinx theme from readthedocs.org (common files)

• rec: python3-boto

  interface en Python pour les services internet d’Amazon –⋅Python 3.x

• rec: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

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