Paquet : tantan (22-1)

[ Paquet source : tantan  ]

masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences

Tantan est un outil pour masquer des régions simples (peu complexes et avec peu de répétitions en tandem sur une période courte) dans des séquences d'ADN, d'ARN et de protéines. Le but de tantan est d'empêcher les prédictions fausses lorsqu'on cherche des régions homologues entre deux séquences. Les répétitions simples s'alignent souvent fortement, créant de fausses prévisions d'homologie.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: scope::utility, works-with::biological-sequence

Autres paquets associés à tantan

• dep: libc6 (>= 2.4)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
i386	38,9 ko	105,0 ko	[liste des fichiers]