Paquet : hmmer2-pvm (2.3.2+dfsg-6)

[ Paquet source : hmmer2  ]

Programmes HMMER avec support PVM (machine virtuelle parallèle)

HMMER est une implémentation des profils modèles de Markov cachés pour rechercher des séquences biologiques dans des banques de données en les interrogeant avec des alignements multiples de séquences.

À partir d'un alignement multiple de séquences, HMMER construit un modèle statistique appelé « modèle de Markov caché », qui peut ensuite être utilisé pour interroger une banque de séquences afin de trouver plus d'homologues à la famille de séquences et, éventuellement, de les aligner.

Ce paquet contient les programmes HMMER compilés avec le support PVM (« Parallel Virtual Machine »).

Autres paquets associés à hmmer2-pvm

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [non arm64]

• dep: libpvm3

  Parallel Virtual Machine - shared libraries

• dep: libsquid1

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• dep: pvm

  Machine virtuelle parallèle - exécutables

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-6)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

Télécharger hmmer2-pvm

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	97,2 ko	532,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	84,3 ko	484,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	77,8 ko	340,0 ko	[liste des fichiers]
i386	105,7 ko	640,0 ko	[liste des fichiers]