Paquet : seqmagick (0.7.0-1)

[ Paquet source : seqmagick  ]

imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO

Seqmagick is a little utility to expose the file format conversion in BioPython in a convenient way.

Features include:

 * Modifying sequences:
   - Remove gaps
   - Reverse & reverse complement
   - Trim to a range of residues
   - Change case
   - Sort by length or ID
 * Displaying information about sequence files
 * Subsetting sequence files by:
   - Position
   - ID
   - Deduplication
 * Filtering sequences by quality score
 * Trimming alignments to a region of interest defined by the forward
   and reverse primers

Autres paquets associés à seqmagick

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-biopython

  Python library for bioinformatics (implemented in Python 3)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	40,3 ko	224,0 ko	[liste des fichiers]