Paquet : predictprotein (1.1.08-1)

[ Paquet source : predictprotein  ]

suite of protein sequence analysis tools

PredictProtein is a sequence analysis suite providing prediction of protein structure and function.

PredictProtein takes a protein sequence as input and provides the following per-residue, or whole protein annotations:

 * secondary structure
 * solvent accessibility
 * multiple sequence alignments
 * PROSITE sequence motifs
 * low-complexity regions
 * nuclear localisation signals
 * regions lacking regular structure (NORS)
 * unstructured loops
 * transmembrane helices
 * transmembrane beta barrels
 * coiled-coil regions
 * disulfide-bonds
 * disordered regions
 * B-value flexibility
 * protein-protein interaction sites
 * Gene Ontology terms

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• dep: proftmb

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• dep: reprof

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• sug: pp-cache-mgr (>= 1.0.3)

  Paquet indisponible

• sug: pp-popularity-contest

  PredictProtein popularity contest

• sug: predictprotein-nonfree

  Paquet indisponible

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