Paquet : surankco (0.0.r5+dfsg-2)

[ Paquet source : surankco  ]

Supervised Ranking of Contigs in de novo Assemblies

SuRankCo is a machine learning based software to score and rank contigs from de novo assemblies of next generation sequencing data. It trains with alignments of contigs with known reference genomes and predicts scores and ranking for contigs which have no related reference genome yet.

Autres paquets associés à surankco

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• dep: r-cran-optparse

  analyseur syntaxique d’options de ligne de commande de GNU R

• dep: r-cran-randomforest

  paquet de GNU R mettant en œuvre le classificateur de forêts aléatoires

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	74,9 ko	157,0 ko	[liste des fichiers]