Paquet : readucks (0.0.3-2)

[ Paquet source : readucks  ]

Nanopore read de-multiplexer (read demux -> readux -> readucks, innit)

This package is inspired by the demultiplexing options in porechop but without the adapter trimming options - it just demuxes. It uses the parasail library with its Python bindings to do pairwise alignment which provides a considerable speed up over the seqan library used by porechop due to its low-level use of vector processor instructions.

Autres paquets associés à readucks

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-biopython

  bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

• dep: python3-parasail

  Python3 bindings for the parasail C library

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	19,8 ko	107,0 ko	[liste des fichiers]