Paquet : deepnano (0.0+git20170813.e8a621e-3.1)

[ Paquet source : deepnano  ]

alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences

DeepNano is alternative basecaller for Oxford Nanopore MinION reads based on deep recurrent neural networks.

Currently it works with SQK-MAP-006 and SQK-MAP-005 chemistry and as a postprocessor for Metrichor.

Autres paquets associés à deepnano

• dep: deepnano-data

  alternative basecaller for MinION reads of genomic sequences (data)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  Paquet indisponible

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-dateutil

  extensions puissantes du module datetime standard de Python⋅3

• dep: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-theano

  CPU/GPU math expression compiler for Python 3

• rec: python3-watchdog

  Python API and shell utilities to monitor file system events

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
s390x	19,8 ko	90,0 ko	[liste des fichiers]