Paquet : r-cran-rsgcc (1.0.6-2 et autres)

[ Paquet source : r-cran-rsgcc  ]

Gini correlation and clustering of gene expression data

This package provides functions for calculating associations between two genes with five correlation methods(e.g., the Gini correlation coefficient [GCC], the Pearson's product moment correlation coefficient [PCC], the Kendall tau rank correlation coefficient [KCC], the Spearman's rank correlation coefficient [SCC] and the Tukey's biweight correlation coefficient [BiWt], and three non-correlation methods (e.g., mutual information [MI] and the maximal information-based nonparametric exploration [MINE], and the euclidean distance [ED]). It can also been implemented to perform the correlation and clustering analysis of transcriptomic data profiled by microarray and RNA-Seq technologies. Additionally, this package can be further applied to construct gene co-expression networks (GCNs).

Autres paquets associés à r-cran-rsgcc

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [non arm64, ppc64el]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.0.0-3)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-biwt

  biweight mean vector and covariance and correlation

• dep: r-cran-cairodevice

  pilote de périphérique Cairo/Gtk2 pour GNU R

• dep: r-cran-fbasics

  paquet de GNU R pour l’ingénierie financière – fBasics

• dep: r-cran-gplots

  paquet de GNU R d’outils de tracé de données de Greg Warnes et autres

• dep: r-cran-gwidgets

  gWidgets API for Toolkit-Independent, Interactive GUIs

• dep: r-cran-gwidgetsrgtk2

  Toolkit Implementation of gWidgets for RGtk2

• dep: r-cran-minerva

  Maximal Information-Based Nonparametric Exploration

• dep: r-cran-parmigene

  information mutuelle en parrallèle pour établir des réseaux géniques

• dep: r-cran-snowfall

  GNU R easier cluster computing (based on snow)

• dep: r-cran-stringr

  Make it easier to work with strings

• sug: r-bioc-ctc

  conversion d’arbre et de regroupement

• sug: r-cran-bigmemory

  Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files

Télécharger r-cran-rsgcc

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1.0.6-2+b1	172,5 ko	247,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.0.6-2+b1	171,6 ko	243,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.0.6-2+b1	173,3 ko	246,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.0.6-2+b1	171,2 ko	238,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.0.6-2+b1	172,8 ko	246,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.0.6-2+b1	172,2 ko	243,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1.0.6-2+b1	172,2 ko	243,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.0.6-2+b1	173,9 ko	291,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.0.6-2+b1	172,3 ko	247,0 ko	[liste des fichiers]