Paquet : r-cran-phytools (0.7-70-1)

[ Paquet source : r-cran-phytools  ]

GNU R phylogenetic tools for comparative biology

A wide range of functions for phylogenetic analysis. Functionality is concentrated in phylogenetic comparative biology, but also includes a diverse array of methods for visualizing, manipulating, reading or writing, and even inferring phylogenetic trees and data. Included among the functions in phylogenetic comparative biology are various for ancestral state reconstruction, model-fitting, simulation of phylogenies and data, and multivariate analysis. There are a broad range of plotting methods for phylogenies and comparative data which include, but are not restricted to, methods for mapping trait evolution on trees, for projecting trees into phenotypic space or a geographic map, and for visualizing correlated speciation between trees. Finally, there are a number of functions for reading, writing, analyzing, inferring, simulating, and manipulating phylogenetic trees and comparative data not covered by other packages. For instance, there are functions for randomly or non-randomly attaching species or clades to a phylogeny, for estimating supertrees or consensus phylogenies from a set, for simulating trees and phylogenetic data under a range of models, and for a wide variety of other manipulations and analyses that phylogenetic biologists might find useful in their research.

Autres paquets associés à r-cran-phytools

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-base-core (>= 4.0.2-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-ape (>= 4.0)

  paquet de GNU R pour l’analyse de phylogénie et d’évolution

• dep: r-cran-clustergeneration

  GNU R random cluster generation (with specified degree of separation)

• dep: r-cran-coda

  analyses et diagnostics de sorties de simulations MCMC dans R

• dep: r-cran-combinat

  GNU R package with utilities for combinatorics

• dep: r-cran-expm

  GNU R Computation of the matrix exponential and related quantities

• dep: r-cran-gtools

  paquet GNU R avec des outils de programmation en R par Greg Warnes et al.

• dep: r-cran-maps

  aide de GNU R pour fabriquer des cartes géographiques

• dep: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• dep: r-cran-mnormt

  paquet de GNU R pour les distributions normales et de Student multidimensionnelles

• dep: r-cran-nlme

  paquet de GNU R pour les modèles mixtes (non)linéaires

• dep: r-cran-numderiv

  paquet de GNU R pour des dérivées numériques précises

• dep: r-cran-phangorn (>= 2.3.1)

  GNU R package for phylogenetic analysis

• dep: r-cran-plotrix

  paquet GNU R qui fournit diverses fonctions de traçage

• dep: r-cran-scatterplot3d

  paquet de GNU R pour la visualisation de données multivariables

• sug: r-cran-animation

  GNU R gallery of animations and utilities to create animations

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-cran-rgl

  paquet de GNU R pour la visualisation en trois dimensions avec OpenGL

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