Paquet : python3-cobra (0.21.0-1)

[ Paquet source : python-cobra  ]

modélisation basée sur les contraintes de réseaux biologiques avec Python 3

Les méthodes COBRA (COnstraint-Based Reconstruction and Analysis) sont largement utilisées pour la modélisation à l’échelle du génome de réseaux métaboliques dans les procaryotes et les eucaryotes. COBRApy est un paquet de modélisation basée sur les contraintes qui a été conçu pour s’adapter à la complexité biologique de la prochaine génération de modèles COBRA et fournir un accès aux méthodes COBRA communément utilisées, telles que l’analyse d’équilibre de flux (FBA), l’analyse de fluctuation de flux (FVA) et l’analyse de destruction de gènes.

Autres paquets associés à python3-cobra

• dep: python-cobra-data (= 0.21.0-1)

  constraint-based modeling of biological networks (data)

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-appdirs (<< 2)

  détermination des répertoires adéquats selon la plateforme – Python 3

  dep: python3-appdirs (>= 1.4)

• dep: python3-depinfo

  retrieve and print Python 3 package dependencies

• dep: python3-diskcache

  Python3 module for disk and file backed persistent cache

• dep: python3-future

  prise en charge d’un source unique pour Python 3 et 2 – Python 3.x

• dep: python3-httpx

  next generation HTTP client

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-optlang

  sympy based mathematical programming language (Python 3)

• dep: python3-pandas (>= 0.17.0)

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

• dep: python3-pydantic

  Data validation and settings management using Python type hinting

• dep: python3-rich

  render rich text, tables, progress bars, syntax highlighting, markdown and more

• dep: python3-ruamel.yaml

  roundtrip YAML parser/emitter (Python 3 module)

• dep: python3-sbml5

  System Biology Markup Language library - Python3 bindings

• dep: python3-simplejson

  simple, fast, extensible JSON encoder/decoder for Python 3.x

• dep: python3-six

  bibliothèque de compatibilité Python⋅2 et⋅3 –⋅interface Python⋅3

• dep: python3-swiglpk (>= 4.65.1)

  Plain Python bindings for the GNU Linear Programming Kit (Python 3)

• dep: python3-tabulate

  pretty-print tabular data in Python3

• sug: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3

• sug: qsopt-ex

  résolveur exact d’optimisation linéaire

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	110,9 ko	609,0 ko	[liste des fichiers]