Paquet : python3-gffutils (0.10.1-2)

[ Paquet source : python-gffutils  ]

Work with GFF and GTF files in a flexible database framework

A Python package for working with and manipulating the GFF and GTF format files typically used for genomic annotations. Files are loaded into a sqlite3 database, allowing much more complex manipulation of hierarchical features (e.g., genes, transcripts, and exons) than is possible with plain-text methods alone.

Autres paquets associés à python3-gffutils

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-argcomplete

  bash tab completion for argparse (for Python 3)

• dep: python3-argh

  enveloppe simple d’argparse – Python 3

• dep: python3-biopython

  bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

• dep: python3-pyfaidx

  efficient random access to fasta subsequences for Python 3

• dep: python3-simplejson

  simple, fast, extensible JSON encoder/decoder for Python 3.x

• dep: python3-six (>= 1.12.0)

  bibliothèque de compatibilité Python⋅2 et⋅3 –⋅interface Python⋅3

• rec: python3-pybedtools

  enveloppe de Python 3 pour BEDTools pour des tâches de bio-informatique

Télécharger python3-gffutils

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	1 004,3 ko	9 642,0 ko	[liste des fichiers]