[ Paquet source : srst2 ]
Paquet : srst2 (0.2.0-8)
Liens pour srst2
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source srst2 :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Étienne Mollier (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [katholt.github.io]
Paquets similaires :
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Autres paquets associés à srst2
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- dep: bowtie2
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
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- dep: cd-hit
- suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-biopython
- bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
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- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
un paquet virtuel est également fourni par python3-rpy2
Télécharger srst2
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|
| mips64el | 59,7 ko | 255,0 ko | [liste des fichiers] |