Paquet : minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Paquet source : minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Autres paquets associés à minia

• dep: bc

  langage de calculateur de précision arbitraire bc GNU

• dep: libc6 (>= 2.4)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.2+dfsg)

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g

  Bibliothèque de compression - binaires

• rec: samtools

  traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM

• sug: bandage

  application de bio-informatique pour navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo

Télécharger minia

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
mips64el	379,7 ko	779,0 ko	[liste des fichiers]