[ Paquet source : seqtools ]
Paquet : belvu (4.44.1+dfsg-6 et autres)
Liens pour belvu
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source seqtools :
- [seqtools_4.44.1+dfsg-6.dsc]
- [seqtools_4.44.1+dfsg.orig.tar.xz]
- [seqtools_4.44.1+dfsg-6.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.sanger.ac.uk]
Paquets similaires :
visualisateur d’alignements de séquences multiples et outil phylogénétique
Belvu est un est un visualisateur d’alignements de séquences multiples et un outil phylogénétique avec un grand ensemble de modes personnalisables de coloration de résidus.
– vue d’alignements de séquences multiples ; – coloration des résidus selon la conservation, avec des seuils et couleurs personnalisables ; – coloration des résidus selon les types (personnalisables) ; – schémas de couleur importables ou exportables ; – récupération des inscriptions de Swissprot (ou PIR) par double clic ; – suivi aisé de la position dans l’alignement ; – suppression manuelle de lignes et colonnes ; – édition automatique de lignes et colonnes, basée sur des critères personnalisables : — suppression de toutes les colonnes avec trous, — suppression de tous les trous, — suppression de toutes les séquences redondantes, — suppression d’une colonne selon un pourcentage personnalisable de trous, — filtrage de séquences selon le pourcentage d’identités, — suppression de séquences selon un pourcentage personnalisable de trous, — suppression de séquences incomplètes (celles commençant ou finissant par des trous, — suppression de colonnes par conservation (avec des seuils hauts et bas personnalisables) ; – enregistrement des alignements aux formats Stockholm, Selex, MSF ou FASTA ; – matrices de distances entre séquences créées en utilisant différentes métriques de distance ; – matrices de distances importables ou exportables ; – construction d’arbres phylogénétiques basée sur différents algorithmes de reconstruction d’arbre basés sur la distance ; – enregistrement des arbres au format New Hampshire ; – reconstruction phylogénétique par technique « bootstrap ».
Autres paquets associés à belvu
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.2.4)
- Bibliothèque graphique vectorielle Cairo 2D
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- dep: libcurl4 (>= 7.16.2)
- bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec OpenSSL
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- dep: libgbtools0 (>= 4.44.1+dfsg)
- library for visualising sequence alignments
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- dep: libglib2.0-0 (>= 2.22.0)
- bibliothèque GLib de routines C
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- dep: libgtk2.0-0 (>= 2.12.0)
- bibliothèque d'interface graphique utilisateur GTK –⋅version ancienne
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- dep: libpango-1.0-0 (>= 1.14.0)
- Mise en place et rendu de texte internationalisé
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- dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
Télécharger belvu
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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mips64el | 4.44.1+dfsg-6+b1 | 1 034,6 ko | 1 332,0 ko | [liste des fichiers] |