Paquet : lighter (1.1.2-5)

[ Paquet source : lighter  ]

fast and memory-efficient sequencing error corrector

Lighter is a fast, memory-efficient tool for correcting sequencing errors. Lighter avoids counting k-mers. Instead, it uses a pair of Bloom filters, one holding a sample of the input k-mers and the other holding k-mers likely to be correct. As long as the sampling fraction is adjusted in inverse proportion to the depth of sequencing, Bloom filter size can be held constant while maintaining near-constant accuracy. Lighter is parallelized, uses no secondary storage, and is both faster and more memory-efficient than competing approaches while achieving comparable accuracy.

Autres paquets associés à lighter

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, i386, mipsel]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: libstdc++6 (>= 5)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger lighter

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	45,6 ko	124,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	43,9 ko	116,0 ko	[liste des fichiers]
armel	43,7 ko	119,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	43,8 ko	103,0 ko	[liste des fichiers]
i386	50,5 ko	131,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	48,6 ko	131,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	52,4 ko	137,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	48,9 ko	180,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	45,4 ko	128,0 ko	[liste des fichiers]