Paquet : sniffles (1.0.12b+ds-1)

[ Paquet source : sniffles  ]

structural variation caller using third-generation sequencing

Sniffles is a structural variation (SV) caller using third-generation sequencing data such as those from Pacific Biosciences or Oxford Nanopore platforms. It detects all types of SVs using evidence from split-read alignments, high-mismatch regions, and coverage analysis.

Autres paquets associés à sniffles

• dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

  bibliothèque dynamique de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• sug: bwa

  dispositif d'alignement Burrows-Wheeler

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
i386	717,0 ko	1 127,0 ko	[liste des fichiers]