Paquet : ruby-bio (2.0.1-2)

[ Paquet source : ruby-bio  ]

outils de Ruby pour la biologie informatique moléculaire

Le projet BioRuby vise à mettre en œuvre un environnement de développement intégré pour la bioinformatique avec le langage Ruby. La philosophie de conception est de « garder simple les éléments » pour maximiser l’utilisabilité et l’efficacité pour les biologistes en tant qu’outil de tous les jours. Le projet a débuté au Japon et est entretenu par l’Université du Japon (Human Genome Center), l’Université de Kyoto (Bioinformatics Center) et l’Open Bio Foundation.

Autres paquets associés à ruby-bio

• dep: ruby

  interpréteur pour le langage de script orienté objet Ruby – version par défaut

  ou ruby-interpreter

  Paquet indisponible

• rec: blast2

  Paquet indisponible

• rec: hmmer

  profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

• rec: mafft

  programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés

• rec: muscle

  Programme d'alignements multiples de séquences de protéine

• rec: probcons

  alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste

• rec: sim4

  Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique

• rec: t-coffee

  alignement multiple de séquences

• sug: clustalw

  alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

• sug: emboss

  ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	633,3 ko	2 776,0 ko	[liste des fichiers]