Paquet : proalign (0.603-5)
Liens pour proalign
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source proalign :
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Andreas Tille (Page QA)
- Thorsten Alteholz (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [loytynojalab.biocenter.helsinki.fi]
Paquets similaires :
logiciel d'alignements de multiples séquences probabilistes
Le logiciel ProAlign réalise des alignements de séquences probabilistes en utilisant le modèle de Markov caché. Il inclut une interface graphique utilisateur permettant de: (i) réaliser des alignements de nucléotides ou d'acides aminés (ii) visionner la qualité des solutions (iii) filtrer les régions considérées non fiables de l'alignement (iv) exporter les alignements vers d'autres logiciels
Le logiciel ProAlign une méthode progressive, telle que l'alignement de multiples séquences est créé par étapes en réalisant des alignements par paires dans les noeuds d'un arbre de guidage . Les séquences sont décrites avec des vecteurs de probabilité de symboles, et chaque alignement par paires, reconstruit la séquence ancestrale (parente) en calculant les probabilités de différents symboles selon un modèle évolutif.
Autres paquets associés à proalign
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- dep: default-jre
- environnement d'exécution Java standard ou compatible
Télécharger proalign
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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i386 | 162,3 ko | 182,0 ko | [liste des fichiers] |