Paquet : hmmer2 (2.3.2+dfsg-7)

[ Paquet source : hmmer2  ]

profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

HMMER est une implémentation des profils de modèles de Markov cachés pour rechercher des séquences biologiques dans des banques de données en les interrogeant avec des alignements multiples de séquences.

À partir d'un alignement multiple de séquences, HMMER construit un modèle statistique appelé « modèle de Markov caché », qui peut ensuite être utilisé pour interroger une banque de séquences afin de trouver plus d'homologues à la famille de séquences et, éventuellement, de les aligner.

Autres paquets associés à hmmer2

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libsquid1 (>= 1.9g+cvs20050121)

  biosquid dynamic library for biological sequence analysis

• rec: biosquid

  utilitaire d'analyse de séquences biologiques

• sug: hmmer2-doc (>= 2.3.2+dfsg-7)

  profile hidden Markov models for protein sequence analysis (docs)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	309,7 ko	2 167,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	280,1 ko	2 009,0 ko	[liste des fichiers]
armel	271,6 ko	2 030,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	271,9 ko	1 610,0 ko	[liste des fichiers]
i386	316,4 ko	2 490,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	308,3 ko	2 357,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	305,0 ko	2 262,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	310,9 ko	2 968,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	292,8 ko	2 233,0 ko	[liste des fichiers]