Paquet : bedtools (2.30.0+dfsg-1)
Liens pour bedtools
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source bedtools :
- [bedtools_2.30.0+dfsg-1.dsc]
- [bedtools_2.30.0+dfsg.orig.tar.xz]
- [bedtools_2.30.0+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
- Debian Med Packaging Team (Page QA, Archive du courrier électronique)
- Charles Plessy (Page QA)
- Andreas Tille (Page QA)
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
Les utilitaires BEDTools permettent de traiter les tâches génomiques ordinaires telles que trouver les chevauchements de caractéristiques et informatiser les données. Les utilitaires sont en grande partie basés sur quatre formats de fichier très utilisés : BED, GFF/GTF, VCF et SAM/BAM. En utilisant BEDTools, il est possible de développer des enchainements sophistiqués qui répondent à des questions de recherche en utilisant plusieurs outils séquentiellement.
L'outil groupBy est fourni par le paquet filo.
Autres paquets associés à bedtools
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- dep: libbz2-1.0
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.5)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- librairie de compression au format XZ
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger bedtools
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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armel | 535,4 ko | 1 759,0 ko | [liste des fichiers] |