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Paquet : aevol (5.0+ds-2)

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modèle numérique de génétique pour lancer des expériences d'évolution in silico

Aevol est un modèle numérique de génétique : des populations d'organismes numériques sont assujetties à un processus de sélection et de variation, qui crée une dynamique Darwinienne.

En modifiant les caractéristiques de sélection (par exemple, la taille de la population, le type d'environnement, les variations environnementales) ou de variation (par exemple, les taux de mutation, les taux de réarrangement chromosomique, les types de réarrangement, le transfert horizontal), on peut étudier expérimentalement l'impact de ces paramètres sur la structure d'organismes évolués. En particulier, puisque Aevol intègre un modèle de génome précis et réaliste, il permet l'étude de variations structurelles du génome (par exemple, le nombre de gènes, la synténie, la proportion de séquences de codage).

La plate-forme de simulation est livrée avec un ensemble d'outils pour l'analyse des phylogénies et la mesure de plusieurs caractéristiques des organismes et populations au cours de l'évolution.

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