Paquet : python3-pbcore (1.7.1+git20200430.a127b1e+dfsg-1)

[ Paquet source : python-pbcore  ]

bibliothèque de Python 3 pour traiter les fichiers de données de PacBio

Le paquet pbcore fournit des modules de Python pour traiter les fichiers de données de Pacific Biosciences et construire des applications bioinformatiques PacBio. Ces modules incluent des outils pour lire et écrire aux formats de données de PacBio, des fichiers de données d’échantillons pour le test et le débogage, des classes basiques et des utilitaires pour construire des applications bioinformatiques.

Ce paquet fait partie de la suite SMRTAnalysis.

Ce paquet fournit le module en Python 3.

Autres paquets associés à python3-pbcore

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-biopython (>= 1.74)

  bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-pysam (>= 0.13)

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

• rec: python3-h5py

  general-purpose Python interface to hdf5

• sug: python-pbcore-doc (= 1.7.1+git20200430.a127b1e+dfsg-1)

  Python library for processing PacBio data files (documentation)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	2 813,0 ko	4 597,0 ko	[liste des fichiers]