Paquet : apbs (3.0.0+dfsg1-3 et autres)

[ Paquet source : apbs  ]

solveur adaptatif de Poisson Boltzmann

APBS est un paquet pour la résolution numérique de l'équation de Poisson-Boltzmann (PBE), un des modèles continus les plus populaires décrivant les interactions entre solutés moléculaires en milieu aqueux et salin. Le continuum électrostatique joue un rôle important dans plusieurs domaines de la simulation biomoléculaire, incluant :

 – la simulation des processus de diffusion pour déterminer les cinétiques
    de liaison ligand-protéine et protéine-protéine ;
 – la dynamique moléculaire de solvatation des biomolécules ;
 – le calcul de l'énergie de solvatation et de liaison pour déterminer
   les constantes d'équilibre de liaison ligand-protéine et
   protéine-protéine afin d'aider à la conception rationnelle de
   médicaments ;
 – les études de titration biomoléculaire.

APBS est conçu pour évaluer efficacement les propriétés électrostatiques pour de telles simulations dans un large spectre d'échelles de longueur pour permettre l'étude de molécules de dix à des millions d'atomes.

Ce paquet fournit de programme apbs et des utilitaires.

Étiquettes: Domaine: Chimie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Champ d'application: Utilitaire

Autres paquets associés à apbs

• dep: apbs-data (= 3.0.0+dfsg1-3)

  fichiers de données pour APBS (solveur adaptatif de Poisson Boltzmann)

• dep: libapbs3 (= 3.0.0+dfsg1-3+b1)

  solveur adaptatif de Poisson Boltzmann

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libmaloc1 (>= 0.2-1)

  Object-oriented Abstraction Layer for C

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  high performance message passing library -- shared library

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	3.0.0+dfsg1-3+b1	78,6 ko	369,0 ko	[liste des fichiers]