alignement de séquences multiples en utilisant les probabilités à postériori de la fonction de partition
Probalign utilise l’estimation de probabilités à postériori de la fonction
de partition pour calculer les alignements de séquence multiple avec la
précision maximale attendue. Il obtient des résultats statistiquement
significativement meilleurs que les programmes d´alignement leaders
Probcons v1.1, MAFFT v5.851 et MUSCLE v3.6 avec les tests de performance
BAliBASE 3.0, HOMSTRAD et OXBENCH. Les améliorations de Probalign sont
plus importantes sur les ensembles de données contenant des extrémités
N/C-terminales et sur les ensembles de données avec des séquences de
longueurs hétérogènes. Sur les ensembles de données de longueurs
hétérogènes contenant des répétitions, la précision d’alignement de
Probalign est 10 % et 15 % meilleure que les trois autres méthodes quand
l´écart-type de longueur est au moins 300 et 400.
