Paquet : mecat2 (0.0+git20200428.f54c542+ds-3)

[ Paquet source : mecat2  ]

ultra-fast and accurate de novo assembly tools for SMRT reads

An improved version of MECAT. It is an ultra-fast and accurate mapping and error correcting de novo assembly tools for single molecula sequencing (SMRT) reads. MECAT2 consists of the following three modules:

 1. mecat2map: a fast and accurate alignment tool for SMRT reads.
 2. mecat2cns: correct noisy reads based on their pairwise overlaps.
 3. fsa: a string graph based assembly tool.

Autres paquets associés à mecat2

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 6)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger mecat2

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	749,5 ko	4 053,0 ko	[liste des fichiers]