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Paquet : nanofilt (2.6.0-3)

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filtrage et ajustement de données de séquençage de longues lectures

Filtrage et ajustement de données de séquençage de longues lectures. Filtrage selon la qualité ou la longueur de lecture et, facultativement, ajustage après application de filtres. Lectures à partir de stdin, écritures sur stdout. De manière facultative, lecture directement à partir d’un fichier non compressé indiqué sur la ligne de commande.

Conception destinée à une utilisation :

 1. Directement après une extraction fastq ;
 2. Avant un mappage ;
 3. Dans un flux entre extraction et mappage.

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