Paquet : python3-biotools (1.2.12-5)

[ Paquet source : python-biotools  ]

Python3 bioinformatics utilities for high-throughput genomic sequencing

This package contains utilities like

 biotools.align - align sequences (hybrid between Needleman-Wunsch and
                  Smith-Waterman which is used to find the subsequence
                  within a larger sequence that best aligns to a reference)
 biotools.annotation - create annotation files. The annotations can be used
                       to create a hierarchy among the annotations
 biotools.BLAST - manage BLAST databases and interface with the BLAST+
                  standalone program available from NCBI.
 biotools.clustal - interface to clustalw global (multiple nucleotide or
                    peptide sequence alignment)
 biotools.complement - creates the complement of a sequence, which can then be
                       reversed
 biotools.sequence - various tools to deal with sequences
 biotools.translate - translate a nucleotide using the standard genetic code

This package contains the Python3 module.

Autres paquets associés à python3-biotools

• dep: clustalw

  alignement de séquences de nucléotides ou de peptides

• dep: ncbi-blast+

  suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération

  ou ncbi-blast+-legacy

  script d’appel de legacy de BLAST du NCBI

• dep: python3

  langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3

• dep: python3-matplotlib

  système de traçage basé sur Python dans un style similaire à celui Matlab –⋅Python⋅3

• dep: python3-numpy

  gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3

Télécharger python3-biotools

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	28,2 ko	127,0 ko	[liste des fichiers]