[ Paquet source : openms ]
Paquet : topp (2.6.0+cleaned1-3 et autres)
Liens pour topp
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source openms :
- [openms_2.6.0+cleaned1-3.dsc]
- [openms_2.6.0+cleaned1.orig.tar.gz]
- [openms_2.6.0+cleaned1-3.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.openms.de]
Paquets similaires :
ensemble de programmes implémentant The OpenMS Proteomic Pipeline
TOPP (the OpenMS proteomic pipeline) est un pipeline d'analyse de données HPLC/MS. C'est un ensemble de nombreuses petites applications qu'on peut chaîner pour créer des pipelines d'analyse adapés à un problème particulier. Les applications utilisent la bibliothèque libopenms. Certains exemples de ces explications sont :
- TOPPView : un visionneur de données spectométriques de masse. - TOPPAS : un assistant pour concevoir graphiquement des flux TOPP - DTAExtractor : extrait des spectres d'un fichier MS run en plusieurs fichiers au format DTA. - FileConverter : Conversion entre divers formats de fichiers MS. - FileFilter : Extrait ou manipule des morceaux de données issues de fichiers peak, feature ou consensus feature. - SpectraMerger : Fusionne des spectres issus d'un plan LC/MS, en précurseur ou en blocs RT. - BaselineFilter : supprime la ligne d'un profil de spectre en utilisant un filtre top-hat. - InternalCalibration : Utilisé pour une calibration intrne. - PTModel : Entraîne un modèle de prédiction des peptides protéotypiques à partir d'un plan d'entraînement. - RTPredict : Prédit des temps de rétention pour des peptides en utilisant un modèle entraîné par RTModel. - ExecutePipeline : Exécute des flux de travail créés par TOPPAS.
Autres paquets associés à topp
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- dep: libboost-regex1.74.0-icu72
- paquet virtuel fourni par libboost-regex1.74.0
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: libopenms2.6.0 (= 2.6.0+cleaned1-3+b4)
- library for LC/MS data management and analysis - runtime
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- dep: libqt5core5a (>= 5.11.3) [non amd64, i386]
- module principal de QT⋅5
- dep: libqt5core5a (>= 5.15.1) [amd64, i386]
-
- dep: libqt5gui5 (>= 5.11.3)
- module Qt⋅5 d'interface graphique
- ou libqt5gui5-gles (>= 5.11.3)
- Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant
-
- dep: libqt5widgets5 (>= 5.11.3)
- module de widgets de Qt⋅5
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
-
- dep: libxerces-c3.2
- validating XML parser library for C++
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- dep: openms-common (= 2.6.0+cleaned1-3)
- package for LC/MS data management and analysis - shared data
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- sug: openms-doc
- package for LC/MS data management and analysis - documentation
Télécharger topp
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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amd64 | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 3 042,9 ko | 17 387,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 2 739,1 ko | 20 859,0 ko | [liste des fichiers] |
i386 | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 3 310,2 ko | 17 410,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 2 724,9 ko | 23 473,0 ko | [liste des fichiers] |
mipsel | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 2 764,2 ko | 22 899,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 3 085,0 ko | 23 995,0 ko | [liste des fichiers] |
s390x | 2.6.0+cleaned1-3+b4 | 2 747,9 ko | 17 455,0 ko | [liste des fichiers] |