Paquet : miniasm (0.3+dfsg-4)
Liens pour miniasm
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source miniasm :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées
Miniasm est un assembleur de novo très rapide basé sur OLC (Overlap-Layout- Consensus) pour des lectures longues bruitées. Il prend des auto-mappages de lectures « all-vs-all » (classiquement par mini-carte) comme entrée et produit des graphes d’assemblage au format GFA. Différent des assembleurs traditionnel, miniasm ne possède pas d’étape de consensus. Il concatène simplement des morceaux de séquences de lecture pour générer des séquences unitig. Par conséquent le taux d’erreur par base est similaire à celui des lectures brutes d’entrée.
Autres paquets associés à miniasm
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- rec: minimap
- correspondances approximatives de longues séquences biologiques telles que les lectures d’ADN
Télécharger miniasm
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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s390x | 28,4 ko | 70,0 ko | [liste des fichiers] |